Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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