Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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IFT88Q13099 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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IFT88Q13099 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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IFT88Q13099 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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