Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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