Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CBX1P83916 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CBX1P83916 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CBX1P83916 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CBX1P83916 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CBX1P83916 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CBX1P83916 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CBX1P83916 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CBX1P83916 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL592504.1-201ENST00000605319 439 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CBX1P83916 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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