Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TMPOP42166 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TMPOP42166 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms