Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GLI3P10071 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms