Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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