Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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RFXAPO00287 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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RFXAPO00287 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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RFXAPO00287 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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RFXAPO00287 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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RFXAPO00287 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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RFXAPO00287 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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RFXAPO00287 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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