Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms