Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TDRD12Q587J7 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TDRD12Q587J7 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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