Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms