Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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LAMA3Q16787 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LRRC37A4P-202ENST00000581296 5372 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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