Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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