Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FXNQ16595 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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