Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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