Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NPRL3Q12980 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms