Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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