Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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