Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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