Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms