Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms