Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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