Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TOP3AQ13472 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TOP3AQ13472 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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TOP3AQ13472 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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TOP3AQ13472 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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TOP3AQ13472 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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TOP3AQ13472 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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