Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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HOXD13P35453 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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