Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
ITGB4P16144 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ITGB4P16144 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms