Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms