Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmeff2Q9QYM9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmeff2Q9QYM9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms