Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms