Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG3Q9NT62 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms