Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms