Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms