Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAX2Q96IS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms