Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms