Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms