Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC141Q6ZP82 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms