Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms