Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms