Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN9AQ15858 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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