Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2H2Q13888 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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