Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms