Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC25A11Q02978 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms