Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms