Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKB2Q00653 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms