Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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