Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYW8

RBAK, RB-associated KRAB zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKQ9NYW8 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBAKQ9NYW8 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms