Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms