Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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