Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IL36G-202ENST00000376489 989 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL603839.3-201ENST00000450713 605 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SL236P-201ENST00000484759 284 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL390726.2-201ENST00000504791 343 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR13Z2P-201ENST00000606338 555 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 BX005195.1-201ENST00000618097 1198 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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