Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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