Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms